Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGB4P16144 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms