Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HKR1P10072 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms