Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms