Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
JRKO75564 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
JRKO75564 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
JRKO75564 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
JRKO75564 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
JRKO75564 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
JRKO75564 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
JRKO75564 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
JRKO75564 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
JRKO75564 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
JRKO75564 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
JRKO75564 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JRKO75564 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JRKO75564 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JRKO75564 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JRKO75564 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JRKO75564 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JRKO75564 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JRKO75564 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JRKO75564 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JRKO75564 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JRKO75564 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JRKO75564 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JRKO75564 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
JRKO75564 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JRKO75564 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JRKO75564 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
JRKO75564 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms