Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSO75390 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSO75390 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSO75390 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSO75390 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSO75390 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSO75390 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSO75390 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSO75390 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSO75390 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CSO75390 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSO75390 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSO75390 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSO75390 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSO75390 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSO75390 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSO75390 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSO75390 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSO75390 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSO75390 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSO75390 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSO75390 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSO75390 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSO75390 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSO75390 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSO75390 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSO75390 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSO75390 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSO75390 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSO75390 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSO75390 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSO75390 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSO75390 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSO75390 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSO75390 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSO75390 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSO75390 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSO75390 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSO75390 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSO75390 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSO75390 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSO75390 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms