Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GMDSO60547 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GMDSO60547 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GMDSO60547 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GMDSO60547 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GMDSO60547 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GMDSO60547 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GMDSO60547 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GMDSO60547 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GMDSO60547 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GMDSO60547 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GMDSO60547 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GMDSO60547 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GMDSO60547 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GMDSO60547 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GMDSO60547 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GMDSO60547 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GMDSO60547 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GMDSO60547 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GMDSO60547 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GMDSO60547 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GMDSO60547 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GMDSO60547 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GMDSO60547 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GMDSO60547 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GMDSO60547 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
GMDSO60547 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GMDSO60547 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GMDSO60547 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GMDSO60547 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GMDSO60547 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GMDSO60547 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GMDSO60547 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GMDSO60547 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GMDSO60547 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GMDSO60547 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GMDSO60547 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GMDSO60547 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GMDSO60547 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GMDSO60547 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GMDSO60547 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GMDSO60547 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GMDSO60547 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GMDSO60547 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GMDSO60547 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GMDSO60547 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GMDSO60547 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GMDSO60547 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GMDSO60547 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms