Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CREB3O43889 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB3O43889 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB3O43889 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB3O43889 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB3O43889 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB3O43889 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB3O43889 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB3O43889 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB3O43889 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB3O43889 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB3O43889 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB3O43889 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB3O43889 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB3O43889 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB3O43889 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB3O43889 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB3O43889 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CREB3O43889 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CREB3O43889 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CREB3O43889 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB3O43889 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB3O43889 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB3O43889 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB3O43889 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB3O43889 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB3O43889 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB3O43889 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB3O43889 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB3O43889 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB3O43889 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB3O43889 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB3O43889 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB3O43889 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB3O43889 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB3O43889 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB3O43889 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB3O43889 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB3O43889 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB3O43889 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB3O43889 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB3O43889 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB3O43889 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CREB3O43889 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms