Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRC1O43663 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRC1O43663 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRC1O43663 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRC1O43663 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRC1O43663 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRC1O43663 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRC1O43663 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRC1O43663 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRC1O43663 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRC1O43663 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRC1O43663 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRC1O43663 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRC1O43663 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRC1O43663 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRC1O43663 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRC1O43663 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRC1O43663 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRC1O43663 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRC1O43663 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRC1O43663 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRC1O43663 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRC1O43663 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRC1O43663 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRC1O43663 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRC1O43663 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRC1O43663 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRC1O43663 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRC1O43663 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRC1O43663 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRC1O43663 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRC1O43663 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRC1O43663 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRC1O43663 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRC1O43663 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRC1O43663 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRC1O43663 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRC1O43663 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRC1O43663 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRC1O43663 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRC1O43663 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRC1O43663 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRC1O43663 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRC1O43663 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRC1O43663 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRC1O43663 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRC1O43663 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRC1O43663 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRC1O43663 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRC1O43663 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRC1O43663 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRC1O43663 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRC1O43663 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRC1O43663 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRC1O43663 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRC1O43663 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRC1O43663 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRC1O43663 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRC1O43663 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRC1O43663 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRC1O43663 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRC1O43663 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRC1O43663 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRC1O43663 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRC1O43663 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRC1O43663 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRC1O43663 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRC1O43663 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRC1O43663 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRC1O43663 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRC1O43663 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRC1O43663 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRC1O43663 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRC1O43663 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRC1O43663 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRC1O43663 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRC1O43663 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRC1O43663 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRC1O43663 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRC1O43663 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRC1O43663 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRC1O43663 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRC1O43663 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRC1O43663 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRC1O43663 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRC1O43663 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRC1O43663 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRC1O43663 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRC1O43663 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRC1O43663 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRC1O43663 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRC1O43663 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRC1O43663 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRC1O43663 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRC1O43663 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRC1O43663 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRC1O43663 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRC1O43663 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRC1O43663 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRC1O43663 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms