Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SYT7O43581 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SYT7O43581 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SYT7O43581 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SYT7O43581 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SYT7O43581 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SYT7O43581 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SYT7O43581 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SYT7O43581 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT7O43581 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT7O43581 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT7O43581 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT7O43581 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT7O43581 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT7O43581 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT7O43581 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT7O43581 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SYT7O43581 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms