Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF879B4DU55 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms