Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF316A6NFI3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms