Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MEIS3P1A6NDR6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.6 ms