Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TRBV7-4A0A0J9YYF1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms