Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K1

SPO11, Meiotic recombination protein SPO11, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPO11Q9Y5K1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPO11Q9Y5K1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPO11Q9Y5K1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPO11Q9Y5K1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPO11Q9Y5K1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPO11Q9Y5K1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPO11Q9Y5K1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPO11Q9Y5K1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SPO11Q9Y5K1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPO11Q9Y5K1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SPO11Q9Y5K1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SPO11Q9Y5K1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPO11Q9Y5K1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPO11Q9Y5K1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPO11Q9Y5K1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPO11Q9Y5K1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SPO11Q9Y5K1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPO11Q9Y5K1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPO11Q9Y5K1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPO11Q9Y5K1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPO11Q9Y5K1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPO11Q9Y5K1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPO11Q9Y5K1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPO11Q9Y5K1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPO11Q9Y5K1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPO11Q9Y5K1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPO11Q9Y5K1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPO11Q9Y5K1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPO11Q9Y5K1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPO11Q9Y5K1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPO11Q9Y5K1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPO11Q9Y5K1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPO11Q9Y5K1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPO11Q9Y5K1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPO11Q9Y5K1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPO11Q9Y5K1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SPO11Q9Y5K1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPO11Q9Y5K1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPO11Q9Y5K1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPO11Q9Y5K1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPO11Q9Y5K1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPO11Q9Y5K1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPO11Q9Y5K1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPO11Q9Y5K1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPO11Q9Y5K1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPO11Q9Y5K1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPO11Q9Y5K1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPO11Q9Y5K1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPO11Q9Y5K1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPO11Q9Y5K1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPO11Q9Y5K1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPO11Q9Y5K1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPO11Q9Y5K1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPO11Q9Y5K1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPO11Q9Y5K1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPO11Q9Y5K1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPO11Q9Y5K1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPO11Q9Y5K1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPO11Q9Y5K1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPO11Q9Y5K1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPO11Q9Y5K1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPO11Q9Y5K1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPO11Q9Y5K1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPO11Q9Y5K1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPO11Q9Y5K1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPO11Q9Y5K1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPO11Q9Y5K1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPO11Q9Y5K1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPO11Q9Y5K1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPO11Q9Y5K1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPO11Q9Y5K1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPO11Q9Y5K1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPO11Q9Y5K1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPO11Q9Y5K1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPO11Q9Y5K1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPO11Q9Y5K1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPO11Q9Y5K1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SPO11Q9Y5K1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPO11Q9Y5K1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPO11Q9Y5K1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPO11Q9Y5K1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPO11Q9Y5K1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPO11Q9Y5K1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPO11Q9Y5K1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SPO11Q9Y5K1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPO11Q9Y5K1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPO11Q9Y5K1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPO11Q9Y5K1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SPO11Q9Y5K1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPO11Q9Y5K1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPO11Q9Y5K1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPO11Q9Y5K1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPO11Q9Y5K1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPO11Q9Y5K1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPO11Q9Y5K1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPO11Q9Y5K1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPO11Q9Y5K1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPO11Q9Y5K1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPO11Q9Y5K1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPO11Q9Y5K1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
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