Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C5

CHST2, Carbohydrate sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST2Q9Y4C5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHST2Q9Y4C5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHST2Q9Y4C5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHST2Q9Y4C5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHST2Q9Y4C5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHST2Q9Y4C5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST2Q9Y4C5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST2Q9Y4C5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHST2Q9Y4C5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHST2Q9Y4C5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHST2Q9Y4C5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHST2Q9Y4C5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHST2Q9Y4C5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHST2Q9Y4C5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHST2Q9Y4C5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHST2Q9Y4C5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST2Q9Y4C5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST2Q9Y4C5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST2Q9Y4C5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST2Q9Y4C5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST2Q9Y4C5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHST2Q9Y4C5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHST2Q9Y4C5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CHST2Q9Y4C5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHST2Q9Y4C5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHST2Q9Y4C5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST2Q9Y4C5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST2Q9Y4C5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST2Q9Y4C5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST2Q9Y4C5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHST2Q9Y4C5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CHST2Q9Y4C5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHST2Q9Y4C5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHST2Q9Y4C5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHST2Q9Y4C5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST2Q9Y4C5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST2Q9Y4C5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST2Q9Y4C5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST2Q9Y4C5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST2Q9Y4C5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHST2Q9Y4C5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms