Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C5

RNF11, RING finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF11Q9Y3C5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF11Q9Y3C5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF11Q9Y3C5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF11Q9Y3C5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RNF11Q9Y3C5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF11Q9Y3C5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF11Q9Y3C5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF11Q9Y3C5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF11Q9Y3C5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF11Q9Y3C5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF11Q9Y3C5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF11Q9Y3C5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF11Q9Y3C5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF11Q9Y3C5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF11Q9Y3C5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF11Q9Y3C5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF11Q9Y3C5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF11Q9Y3C5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF11Q9Y3C5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF11Q9Y3C5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF11Q9Y3C5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF11Q9Y3C5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF11Q9Y3C5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF11Q9Y3C5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF11Q9Y3C5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF11Q9Y3C5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF11Q9Y3C5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF11Q9Y3C5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF11Q9Y3C5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF11Q9Y3C5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF11Q9Y3C5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF11Q9Y3C5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF11Q9Y3C5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF11Q9Y3C5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF11Q9Y3C5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF11Q9Y3C5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF11Q9Y3C5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms