Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC2Q9Y2U9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHDC2Q9Y2U9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC2Q9Y2U9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHDC2Q9Y2U9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHDC2Q9Y2U9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms