Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GPR55Q9Y2T6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPR55Q9Y2T6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPR55Q9Y2T6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPR55Q9Y2T6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPR55Q9Y2T6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms