Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB41L3Q9Y2J2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB41L3Q9Y2J2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EPB41L3Q9Y2J2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41L3Q9Y2J2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41L3Q9Y2J2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPB41L3Q9Y2J2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPB41L3Q9Y2J2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPB41L3Q9Y2J2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPB41L3Q9Y2J2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPB41L3Q9Y2J2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPB41L3Q9Y2J2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms