Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y277

VDAC3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC3Q9Y277 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VDAC3Q9Y277 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VDAC3Q9Y277 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VDAC3Q9Y277 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VDAC3Q9Y277 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VDAC3Q9Y277 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VDAC3Q9Y277 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VDAC3Q9Y277 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VDAC3Q9Y277 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VDAC3Q9Y277 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VDAC3Q9Y277 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VDAC3Q9Y277 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VDAC3Q9Y277 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VDAC3Q9Y277 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VDAC3Q9Y277 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VDAC3Q9Y277 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VDAC3Q9Y277 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VDAC3Q9Y277 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VDAC3Q9Y277 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VDAC3Q9Y277 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VDAC3Q9Y277 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VDAC3Q9Y277 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VDAC3Q9Y277 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VDAC3Q9Y277 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VDAC3Q9Y277 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms