Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHKBQ9Y259 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHKBQ9Y259 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHKBQ9Y259 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHKBQ9Y259 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.9 ms