Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
USP24Q9UPU5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP24Q9UPU5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP24Q9UPU5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP24Q9UPU5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP24Q9UPU5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP24Q9UPU5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP24Q9UPU5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP24Q9UPU5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP24Q9UPU5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP24Q9UPU5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP24Q9UPU5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP24Q9UPU5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP24Q9UPU5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP24Q9UPU5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP24Q9UPU5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP24Q9UPU5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP24Q9UPU5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP24Q9UPU5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP24Q9UPU5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP24Q9UPU5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP24Q9UPU5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP24Q9UPU5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP24Q9UPU5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP24Q9UPU5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP24Q9UPU5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP24Q9UPU5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP24Q9UPU5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP24Q9UPU5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP24Q9UPU5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP24Q9UPU5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP24Q9UPU5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
USP24Q9UPU5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP24Q9UPU5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP24Q9UPU5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
USP24Q9UPU5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
USP24Q9UPU5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
USP24Q9UPU5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP24Q9UPU5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP24Q9UPU5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
USP24Q9UPU5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
USP24Q9UPU5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
USP24Q9UPU5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
USP24Q9UPU5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP24Q9UPU5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP24Q9UPU5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP24Q9UPU5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP24Q9UPU5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
USP24Q9UPU5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
USP24Q9UPU5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP24Q9UPU5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP24Q9UPU5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP24Q9UPU5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
USP24Q9UPU5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
USP24Q9UPU5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
USP24Q9UPU5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms