Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX12Q9UMY4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX12Q9UMY4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX12Q9UMY4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX12Q9UMY4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms