Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM21

MGAT4A, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4AQ9UM21 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MGAT4AQ9UM21 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MGAT4AQ9UM21 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MGAT4AQ9UM21 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MGAT4AQ9UM21 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms