Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZMYND8Q9ULU4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZMYND8Q9ULU4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZMYND8Q9ULU4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZMYND8Q9ULU4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ZMYND8Q9ULU4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZMYND8Q9ULU4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZMYND8Q9ULU4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZMYND8Q9ULU4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ZMYND8Q9ULU4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZMYND8Q9ULU4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ZMYND8Q9ULU4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZMYND8Q9ULU4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ZMYND8Q9ULU4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZMYND8Q9ULU4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZMYND8Q9ULU4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZMYND8Q9ULU4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZMYND8Q9ULU4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ZMYND8Q9ULU4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZMYND8Q9ULU4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZMYND8Q9ULU4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZMYND8Q9ULU4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ZMYND8Q9ULU4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZMYND8Q9ULU4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZMYND8Q9ULU4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZMYND8Q9ULU4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZMYND8Q9ULU4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZMYND8Q9ULU4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZMYND8Q9ULU4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZMYND8Q9ULU4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ZMYND8Q9ULU4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZMYND8Q9ULU4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZMYND8Q9ULU4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZMYND8Q9ULU4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZMYND8Q9ULU4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZMYND8Q9ULU4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZMYND8Q9ULU4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZMYND8Q9ULU4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZMYND8Q9ULU4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZMYND8Q9ULU4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZMYND8Q9ULU4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZMYND8Q9ULU4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms