Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDRG4Q9ULP0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDRG4Q9ULP0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDRG4Q9ULP0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NDRG4Q9ULP0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms