Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNOT6Q9ULM6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNOT6Q9ULM6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CNOT6Q9ULM6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNOT6Q9ULM6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CNOT6Q9ULM6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms