Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLXNB3Q9ULL4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLXNB3Q9ULL4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLXNB3Q9ULL4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLXNB3Q9ULL4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNB3Q9ULL4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNB3Q9ULL4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNB3Q9ULL4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNB3Q9ULL4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNB3Q9ULL4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PLXNB3Q9ULL4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNB3Q9ULL4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLXNB3Q9ULL4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNB3Q9ULL4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNB3Q9ULL4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNB3Q9ULL4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNB3Q9ULL4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLXNB3Q9ULL4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNB3Q9ULL4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNB3Q9ULL4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNB3Q9ULL4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLXNB3Q9ULL4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PLXNB3Q9ULL4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PLXNB3Q9ULL4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLXNB3Q9ULL4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLXNB3Q9ULL4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PLXNB3Q9ULL4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNB3Q9ULL4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNB3Q9ULL4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNB3Q9ULL4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PLXNB3Q9ULL4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PLXNB3Q9ULL4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLXNB3Q9ULL4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PLXNB3Q9ULL4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PLXNB3Q9ULL4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PLXNB3Q9ULL4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLXNB3Q9ULL4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLXNB3Q9ULL4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PLXNB3Q9ULL4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXNB3Q9ULL4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXNB3Q9ULL4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PLXNB3Q9ULL4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNB3Q9ULL4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PLXNB3Q9ULL4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXNB3Q9ULL4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PLXNB3Q9ULL4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PLXNB3Q9ULL4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PLXNB3Q9ULL4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PLXNB3Q9ULL4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PLXNB3Q9ULL4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms