Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LRFN2Q9ULH4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRFN2Q9ULH4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRFN2Q9ULH4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRFN2Q9ULH4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRFN2Q9ULH4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LRFN2Q9ULH4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRFN2Q9ULH4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRFN2Q9ULH4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRFN2Q9ULH4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRFN2Q9ULH4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRFN2Q9ULH4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRFN2Q9ULH4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRFN2Q9ULH4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRFN2Q9ULH4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRFN2Q9ULH4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRFN2Q9ULH4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRFN2Q9ULH4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms