Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CDC42EP3Q9UKI2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDC42EP3Q9UKI2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDC42EP3Q9UKI2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CDC42EP3Q9UKI2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CDC42EP3Q9UKI2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms