Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
GGA1Q9UJY5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GGA1Q9UJY5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GGA1Q9UJY5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
GGA1Q9UJY5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
GGA1Q9UJY5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GGA1Q9UJY5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GGA1Q9UJY5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GGA1Q9UJY5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GGA1Q9UJY5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
GGA1Q9UJY5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GGA1Q9UJY5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GGA1Q9UJY5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GGA1Q9UJY5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GGA1Q9UJY5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GGA1Q9UJY5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GGA1Q9UJY5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
GGA1Q9UJY5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
GGA1Q9UJY5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GGA1Q9UJY5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GGA1Q9UJY5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GGA1Q9UJY5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GGA1Q9UJY5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GGA1Q9UJY5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GGA1Q9UJY5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GGA1Q9UJY5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GGA1Q9UJY5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GGA1Q9UJY5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GGA1Q9UJY5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GGA1Q9UJY5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GGA1Q9UJY5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GGA1Q9UJY5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GGA1Q9UJY5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GGA1Q9UJY5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GGA1Q9UJY5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GGA1Q9UJY5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GGA1Q9UJY5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GGA1Q9UJY5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GGA1Q9UJY5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
GGA1Q9UJY5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GGA1Q9UJY5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GGA1Q9UJY5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GGA1Q9UJY5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GGA1Q9UJY5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GGA1Q9UJY5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GGA1Q9UJY5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GGA1Q9UJY5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GGA1Q9UJY5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GGA1Q9UJY5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.5 ms