Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBD1Q9UJT1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBD1Q9UJT1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBD1Q9UJT1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBD1Q9UJT1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms