Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIMS3Q9UJD0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIMS3Q9UJD0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RIMS3Q9UJD0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RIMS3Q9UJD0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms