Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPN3Q9UHW5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPN3Q9UHW5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPN3Q9UHW5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPN3Q9UHW5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPN3Q9UHW5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPN3Q9UHW5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPN3Q9UHW5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPN3Q9UHW5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPN3Q9UHW5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPN3Q9UHW5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPN3Q9UHW5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPN3Q9UHW5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPN3Q9UHW5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPN3Q9UHW5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPN3Q9UHW5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms