Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD2

TBK1, Serine/threonine-protein kinase TBK1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBK1Q9UHD2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TBK1Q9UHD2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TBK1Q9UHD2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TBK1Q9UHD2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TBK1Q9UHD2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TBK1Q9UHD2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBK1Q9UHD2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBK1Q9UHD2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TBK1Q9UHD2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBK1Q9UHD2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBK1Q9UHD2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBK1Q9UHD2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TBK1Q9UHD2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBK1Q9UHD2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBK1Q9UHD2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBK1Q9UHD2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TBK1Q9UHD2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TBK1Q9UHD2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBK1Q9UHD2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TBK1Q9UHD2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms