Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTRF1LQ9UGC7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTRF1LQ9UGC7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTRF1LQ9UGC7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTRF1LQ9UGC7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTRF1LQ9UGC7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTRF1LQ9UGC7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTRF1LQ9UGC7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTRF1LQ9UGC7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTRF1LQ9UGC7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTRF1LQ9UGC7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTRF1LQ9UGC7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTRF1LQ9UGC7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MTRF1LQ9UGC7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTRF1LQ9UGC7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTRF1LQ9UGC7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTRF1LQ9UGC7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTRF1LQ9UGC7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTRF1LQ9UGC7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTRF1LQ9UGC7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTRF1LQ9UGC7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MTRF1LQ9UGC7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTRF1LQ9UGC7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTRF1LQ9UGC7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTRF1LQ9UGC7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTRF1LQ9UGC7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTRF1LQ9UGC7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTRF1LQ9UGC7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTRF1LQ9UGC7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTRF1LQ9UGC7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MTRF1LQ9UGC7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTRF1LQ9UGC7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MTRF1LQ9UGC7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTRF1LQ9UGC7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTRF1LQ9UGC7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTRF1LQ9UGC7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTRF1LQ9UGC7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MTRF1LQ9UGC7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTRF1LQ9UGC7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTRF1LQ9UGC7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MTRF1LQ9UGC7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTRF1LQ9UGC7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTRF1LQ9UGC7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms