Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ9

REV1, DNA repair protein REV1, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV1Q9UBZ9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
REV1Q9UBZ9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
REV1Q9UBZ9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
REV1Q9UBZ9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
REV1Q9UBZ9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
REV1Q9UBZ9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REV1Q9UBZ9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REV1Q9UBZ9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
REV1Q9UBZ9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
REV1Q9UBZ9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
REV1Q9UBZ9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REV1Q9UBZ9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
REV1Q9UBZ9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REV1Q9UBZ9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
REV1Q9UBZ9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms