Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMC3IPQ9P2W1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC3IPQ9P2W1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMC3IPQ9P2W1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC3IPQ9P2W1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC3IPQ9P2W1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC3IPQ9P2W1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMC3IPQ9P2W1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC3IPQ9P2W1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMC3IPQ9P2W1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMC3IPQ9P2W1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PSMC3IPQ9P2W1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PSMC3IPQ9P2W1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMC3IPQ9P2W1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PSMC3IPQ9P2W1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC3IPQ9P2W1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC3IPQ9P2W1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC3IPQ9P2W1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC3IPQ9P2W1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC3IPQ9P2W1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PSMC3IPQ9P2W1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMC3IPQ9P2W1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PSMC3IPQ9P2W1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMC3IPQ9P2W1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMC3IPQ9P2W1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PSMC3IPQ9P2W1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMC3IPQ9P2W1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMC3IPQ9P2W1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMC3IPQ9P2W1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMC3IPQ9P2W1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMC3IPQ9P2W1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PSMC3IPQ9P2W1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC3IPQ9P2W1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC3IPQ9P2W1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PSMC3IPQ9P2W1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms