Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ARHGAP28Q9P2N2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGAP28Q9P2N2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGAP28Q9P2N2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGAP28Q9P2N2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGAP28Q9P2N2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGAP28Q9P2N2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGAP28Q9P2N2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ARHGAP28Q9P2N2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGAP28Q9P2N2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGAP28Q9P2N2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ARHGAP28Q9P2N2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP28Q9P2N2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP28Q9P2N2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP28Q9P2N2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP28Q9P2N2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGAP28Q9P2N2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP28Q9P2N2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP28Q9P2N2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP28Q9P2N2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP28Q9P2N2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms