Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KLHL9Q9P2J3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KLHL9Q9P2J3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHL9Q9P2J3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHL9Q9P2J3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms