Protein–RNA interactions for Protein: Q9P217

ZSWIM5, Zinc finger SWIM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM5Q9P217 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZSWIM5Q9P217 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZSWIM5Q9P217 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ZSWIM5Q9P217 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZSWIM5Q9P217 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZSWIM5Q9P217 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZSWIM5Q9P217 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZSWIM5Q9P217 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ZSWIM5Q9P217 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ZSWIM5Q9P217 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
ZSWIM5Q9P217 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZSWIM5Q9P217 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZSWIM5Q9P217 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZSWIM5Q9P217 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZSWIM5Q9P217 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ZSWIM5Q9P217 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZSWIM5Q9P217 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZSWIM5Q9P217 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZSWIM5Q9P217 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZSWIM5Q9P217 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ZSWIM5Q9P217 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ZSWIM5Q9P217 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ZSWIM5Q9P217 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ZSWIM5Q9P217 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZSWIM5Q9P217 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZSWIM5Q9P217 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ZSWIM5Q9P217 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ZSWIM5Q9P217 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
ZSWIM5Q9P217 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZSWIM5Q9P217 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZSWIM5Q9P217 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ZSWIM5Q9P217 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ZSWIM5Q9P217 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZSWIM5Q9P217 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZSWIM5Q9P217 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ZSWIM5Q9P217 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZSWIM5Q9P217 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ZSWIM5Q9P217 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZSWIM5Q9P217 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZSWIM5Q9P217 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZSWIM5Q9P217 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ZSWIM5Q9P217 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZSWIM5Q9P217 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZSWIM5Q9P217 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZSWIM5Q9P217 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZSWIM5Q9P217 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ZSWIM5Q9P217 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZSWIM5Q9P217 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZSWIM5Q9P217 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms