Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
IFNKQ9P0W0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFNKQ9P0W0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFNKQ9P0W0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFNKQ9P0W0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFNKQ9P0W0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFNKQ9P0W0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFNKQ9P0W0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFNKQ9P0W0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFNKQ9P0W0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFNKQ9P0W0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFNKQ9P0W0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
IFNKQ9P0W0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFNKQ9P0W0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFNKQ9P0W0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFNKQ9P0W0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFNKQ9P0W0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IFNKQ9P0W0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IFNKQ9P0W0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFNKQ9P0W0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFNKQ9P0W0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFNKQ9P0W0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
IFNKQ9P0W0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IFNKQ9P0W0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFNKQ9P0W0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFNKQ9P0W0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IFNKQ9P0W0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFNKQ9P0W0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
IFNKQ9P0W0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IFNKQ9P0W0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IFNKQ9P0W0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
IFNKQ9P0W0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFNKQ9P0W0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFNKQ9P0W0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms