Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PKD2L2Q9NZM6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2L2Q9NZM6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2L2Q9NZM6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PKD2L2Q9NZM6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD2L2Q9NZM6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PKD2L2Q9NZM6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2L2Q9NZM6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2L2Q9NZM6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2L2Q9NZM6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2L2Q9NZM6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PKD2L2Q9NZM6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2L2Q9NZM6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2L2Q9NZM6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2L2Q9NZM6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2L2Q9NZM6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PKD2L2Q9NZM6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2L2Q9NZM6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PKD2L2Q9NZM6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PKD2L2Q9NZM6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PKD2L2Q9NZM6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2L2Q9NZM6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2L2Q9NZM6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2L2Q9NZM6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2L2Q9NZM6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PKD2L2Q9NZM6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2L2Q9NZM6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2L2Q9NZM6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2L2Q9NZM6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2L2Q9NZM6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2L2Q9NZM6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2L2Q9NZM6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2L2Q9NZM6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PKD2L2Q9NZM6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2L2Q9NZM6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2L2Q9NZM6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2L2Q9NZM6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PKD2L2Q9NZM6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2L2Q9NZM6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PKD2L2Q9NZM6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms