Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DLL3Q9NYJ7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DLL3Q9NYJ7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DLL3Q9NYJ7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DLL3Q9NYJ7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DLL3Q9NYJ7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DLL3Q9NYJ7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DLL3Q9NYJ7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DLL3Q9NYJ7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DLL3Q9NYJ7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DLL3Q9NYJ7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DLL3Q9NYJ7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DLL3Q9NYJ7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DLL3Q9NYJ7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DLL3Q9NYJ7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DLL3Q9NYJ7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DLL3Q9NYJ7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DLL3Q9NYJ7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DLL3Q9NYJ7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DLL3Q9NYJ7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DLL3Q9NYJ7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DLL3Q9NYJ7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DLL3Q9NYJ7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DLL3Q9NYJ7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DLL3Q9NYJ7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms