Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL28Q9NXS3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL28Q9NXS3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL28Q9NXS3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL28Q9NXS3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms