Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWM3

CUEDC1, CUE domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUEDC1Q9NWM3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUEDC1Q9NWM3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUEDC1Q9NWM3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUEDC1Q9NWM3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUEDC1Q9NWM3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUEDC1Q9NWM3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUEDC1Q9NWM3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUEDC1Q9NWM3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUEDC1Q9NWM3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUEDC1Q9NWM3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUEDC1Q9NWM3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUEDC1Q9NWM3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUEDC1Q9NWM3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUEDC1Q9NWM3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUEDC1Q9NWM3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUEDC1Q9NWM3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUEDC1Q9NWM3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUEDC1Q9NWM3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUEDC1Q9NWM3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUEDC1Q9NWM3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUEDC1Q9NWM3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUEDC1Q9NWM3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUEDC1Q9NWM3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUEDC1Q9NWM3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUEDC1Q9NWM3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUEDC1Q9NWM3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUEDC1Q9NWM3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CUEDC1Q9NWM3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUEDC1Q9NWM3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUEDC1Q9NWM3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CUEDC1Q9NWM3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CUEDC1Q9NWM3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUEDC1Q9NWM3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CUEDC1Q9NWM3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CUEDC1Q9NWM3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CUEDC1Q9NWM3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms