Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ASF1BQ9NVP2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASF1BQ9NVP2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ASF1BQ9NVP2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ASF1BQ9NVP2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms