Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UFSP2Q9NUQ7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UFSP2Q9NUQ7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UFSP2Q9NUQ7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UFSP2Q9NUQ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms