Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUL3

STAU2, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAU2Q9NUL3 ARID3A-205ENST00000587532 1016 ntTSL 518.26■□□□□ 0.515e-7■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 ARID3A-202ENST00000457152 549 ntTSL 513.14□□□□□ -0.315e-7■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.226e-8■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.423e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 PRKCZ-201ENST00000378567 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)23.56■■□□□ 1.363e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 PRKCZ-208ENST00000468310 690 ntTSL 521.64■■□□□ 1.053e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 MTA1-214ENST00000494026 852 ntTSL 518.04■□□□□ 0.483e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 MTA1-216ENST00000498644 871 ntTSL 216.92■□□□□ 0.33e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 PRKCZ-216ENST00000479566 501 ntTSL 316.91■□□□□ 0.33e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 MTA1-210ENST00000481012 987 ntTSL 516.59■□□□□ 0.253e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 MTA1-204ENST00000424723 904 ntTSL 1 (best)15.33■□□□□ 0.043e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 PRKCZ-207ENST00000466651 425 ntTSL 512.03□□□□□ -0.483e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 TNRC18-207ENST00000440081 757 ntTSL 310.98□□□□□ -0.653e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 ERGIC1-211ENST00000523215 3621 ntTSL 1 (best)10.57□□□□□ -0.723e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 NME4-209ENST00000460297 1652 ntTSL 525.21■■□□□ 1.632e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 NME4-204ENST00000433358 966 ntTSL 323.5■■□□□ 1.352e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 NME4-206ENST00000448828 1167 ntTSL 222.98■■□□□ 1.272e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.122e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.122e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.122e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 NME4-205ENST00000444498 1111 ntTSL 319.02■□□□□ 0.642e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.342e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.232e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.12e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 NME4-208ENST00000454619 719 ntTSL 514.11□□□□□ -0.152e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 LPCAT1-203ENST00000503252 2694 ntTSL 219.5■□□□□ 0.717e-7■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 LPCAT1-202ENST00000475622 5610 ntTSL 518.47■□□□□ 0.557e-7■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.331e-9■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.17e-7■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.575e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 SPIRE2-209ENST00000566337 1369 ntTSL 523.02■■□□□ 1.285e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.165e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.725e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 SPIRE2-206ENST00000564878 663 ntTSL 318.18■□□□□ 0.55e-6■■□□□ 11.8
STAU2Q9NUL3 MLXIPL-208ENST00000456640 706 ntTSL 517.64■□□□□ 0.412e-6■■□□□ 11.7
STAU2Q9NUL3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.63■□□□□ 0.092e-6■■□□□ 11.7
STAU2Q9NUL3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.092e-6■■□□□ 11.7
STAU2Q9NUL3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.932e-6■■□□□ 11.7
STAU2Q9NUL3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.862e-6■■□□□ 11.7
STAU2Q9NUL3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.752e-6■■□□□ 11.7
STAU2Q9NUL3 F7-203ENST00000444337 564 ntTSL 520.22■□□□□ 0.838e-7■■□□□ 11.7
STAU2Q9NUL3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.388e-7■■□□□ 11.7
STAU2Q9NUL3 F7-206ENST00000541084 2873 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.468e-7■■□□□ 11.7
STAU2Q9NUL3 F7-202ENST00000375581 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.588e-7■■□□□ 11.7
STAU2Q9NUL3 APOBEC3C-201ENST00000361441 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.642e-6■■□□□ 11.7
STAU2Q9NUL3 AL022318.4-201ENST00000381568 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.692e-6■■□□□ 11.7
STAU2Q9NUL3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.266e-7■■□□□ 11.7
STAU2Q9NUL3 GATD1-207ENST00000526650 457 ntTSL 316.65■□□□□ 0.266e-7■■□□□ 11.7
STAU2Q9NUL3 GATD1-204ENST00000465313 446 ntTSL 316.23■□□□□ 0.196e-7■■□□□ 11.7
STAU2Q9NUL3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.076e-7■■□□□ 11.7
STAU2Q9NUL3 GATD1-208ENST00000528309 510 ntTSL 314.77□□□□□ -0.056e-7■■□□□ 11.7
STAU2Q9NUL3 GATD1-201ENST00000319863 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.466e-7■■□□□ 11.7
STAU2Q9NUL3 GATD1-202ENST00000354286 3973 ntTSL 511.12□□□□□ -0.636e-7■■□□□ 11.7
STAU2Q9NUL3 ZMYND8-202ENST00000311275 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.665e-6■■□□□ 11.6
STAU2Q9NUL3 ZMYND8-205ENST00000360911 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.695e-6■■□□□ 11.6
STAU2Q9NUL3 ZMYND8-217ENST00000536340 5273 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.745e-6■■□□□ 11.6
STAU2Q9NUL3 ZMYND8-220ENST00000617418 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.745e-6■■□□□ 11.6
STAU2Q9NUL3 ZMYND8-215ENST00000468376 4064 ntTSL 1 (best)9.98□□□□□ -0.815e-6■■□□□ 11.6
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STAU2Q9NUL3 ZMYND8-213ENST00000461685 3567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.895e-6■■□□□ 11.6
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STAU2Q9NUL3 ZMYND8-218ENST00000540497 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.965e-6■■□□□ 11.6
STAU2Q9NUL3 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.995e-6■■□□□ 11.6
STAU2Q9NUL3 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.995e-6■■□□□ 11.6
STAU2Q9NUL3 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.025e-6■■□□□ 11.6
STAU2Q9NUL3 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.065e-6■■□□□ 11.6
STAU2Q9NUL3 ZMYND8-212ENST00000458360 3729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.065e-6■■□□□ 11.6
STAU2Q9NUL3 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.115e-6■■□□□ 11.6
STAU2Q9NUL3 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.115e-6■■□□□ 11.6
STAU2Q9NUL3 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.165e-6■■□□□ 11.6
STAU2Q9NUL3 ZMYND8-210ENST00000446894 341 ntTSL 23.71□□□□□ -1.825e-6■■□□□ 11.6
STAU2Q9NUL3 ZMYND8-209ENST00000441977 175 ntTSL 30.26□□□□□ -2.375e-6■■□□□ 11.6
STAU2Q9NUL3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.038e-7■■□□□ 11.5
STAU2Q9NUL3 NXN-208ENST00000575171 544 ntTSL 29.96□□□□□ -0.828e-7■■□□□ 11.5
STAU2Q9NUL3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.675e-6■■□□□ 11.5
STAU2Q9NUL3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.635e-6■■□□□ 11.5
STAU2Q9NUL3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.65e-6■■□□□ 11.5
STAU2Q9NUL3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.565e-6■■□□□ 11.5
STAU2Q9NUL3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.495e-6■■□□□ 11.5
STAU2Q9NUL3 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.345e-6■■□□□ 11.5
STAU2Q9NUL3 PPIL1-202ENST00000483552 1347 ntTSL 26.45□□□□□ -1.385e-6■■□□□ 11.5
STAU2Q9NUL3 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.385e-6■■□□□ 11.5
STAU2Q9NUL3 MAPK6-203ENST00000558100 514 ntTSL 213.27□□□□□ -0.291e-6■■□□□ 11.4
STAU2Q9NUL3 MAPK6-207ENST00000560774 574 ntTSL 412.62□□□□□ -0.391e-6■■□□□ 11.4
STAU2Q9NUL3 CTAGE5-203ENST00000341502 4091 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.71e-6■■□□□ 11.4
STAU2Q9NUL3 MAPK6-204ENST00000558841 656 ntTSL 28.95□□□□□ -0.981e-6■■□□□ 11.4
STAU2Q9NUL3 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.141e-6■■□□□ 11.4
STAU2Q9NUL3 MAPK6-208ENST00000560802 552 ntTSL 46.77□□□□□ -1.331e-6■■□□□ 11.4
STAU2Q9NUL3 MAPK6-205ENST00000558891 583 ntTSL 34.37□□□□□ -1.711e-6■■□□□ 11.4
STAU2Q9NUL3 MAPK6-202ENST00000558063 583 ntTSL 43.05□□□□□ -1.921e-6■■□□□ 11.4
STAU2Q9NUL3 MAPK6-206ENST00000560254 574 ntTSL 42.86□□□□□ -1.951e-6■■□□□ 11.4
STAU2Q9NUL3 MTA1-208ENST00000438610 2144 ntTSL 1 (best)19.33■□□□□ 0.681e-6■■□□□ 11.4
STAU2Q9NUL3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.591e-6■■□□□ 11.4
STAU2Q9NUL3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.531e-6■■□□□ 11.4
STAU2Q9NUL3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.151e-6■■□□□ 11.4
STAU2Q9NUL3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.031e-6■■□□□ 11.4
STAU2Q9NUL3 MLXIPL-207ENST00000453275 690 ntTSL 519.92■□□□□ 0.782e-6■■□□□ 11.4
STAU2Q9NUL3 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.062e-6■■□□□ 11.4
STAU2Q9NUL3 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.062e-6■■□□□ 11.4
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