Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
PDS5BQ9NTI5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
PDS5BQ9NTI5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC44.42■■■■■ 4.7
PDS5BQ9NTI5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
PDS5BQ9NTI5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
PDS5BQ9NTI5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.4■■■■■ 4.7
PDS5BQ9NTI5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
PDS5BQ9NTI5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
PDS5BQ9NTI5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
PDS5BQ9NTI5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
PDS5BQ9NTI5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.39■■■■■ 4.7
PDS5BQ9NTI5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
PDS5BQ9NTI5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
PDS5BQ9NTI5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.38■■■■■ 4.69
PDS5BQ9NTI5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC44.38■■■■■ 4.69
PDS5BQ9NTI5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
PDS5BQ9NTI5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
PDS5BQ9NTI5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC44.37■■■■■ 4.69
PDS5BQ9NTI5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
PDS5BQ9NTI5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC44.36■■■■■ 4.69
PDS5BQ9NTI5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC44.36■■■■■ 4.69
PDS5BQ9NTI5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC44.35■■■■■ 4.69
PDS5BQ9NTI5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
PDS5BQ9NTI5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
PDS5BQ9NTI5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
PDS5BQ9NTI5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
PDS5BQ9NTI5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
PDS5BQ9NTI5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
PDS5BQ9NTI5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
PDS5BQ9NTI5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
PDS5BQ9NTI5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
PDS5BQ9NTI5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.68
PDS5BQ9NTI5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
PDS5BQ9NTI5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.31■■■■■ 4.68
PDS5BQ9NTI5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC44.31■■■■■ 4.68
PDS5BQ9NTI5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC44.3■■■■■ 4.68
PDS5BQ9NTI5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.3■■■■■ 4.68
PDS5BQ9NTI5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
PDS5BQ9NTI5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
PDS5BQ9NTI5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
PDS5BQ9NTI5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
PDS5BQ9NTI5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC44.28■■■■■ 4.68
PDS5BQ9NTI5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
PDS5BQ9NTI5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
PDS5BQ9NTI5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC44.27■■■■■ 4.68
PDS5BQ9NTI5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
PDS5BQ9NTI5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
PDS5BQ9NTI5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
PDS5BQ9NTI5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC44.26■■■■■ 4.68
PDS5BQ9NTI5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC44.26■■■■■ 4.68
PDS5BQ9NTI5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.25■■■■■ 4.67
PDS5BQ9NTI5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
PDS5BQ9NTI5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC44.25■■■■■ 4.67
PDS5BQ9NTI5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
PDS5BQ9NTI5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
PDS5BQ9NTI5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
PDS5BQ9NTI5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
PDS5BQ9NTI5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
PDS5BQ9NTI5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
PDS5BQ9NTI5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
PDS5BQ9NTI5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
PDS5BQ9NTI5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
PDS5BQ9NTI5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.67
PDS5BQ9NTI5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC44.19■■■■■ 4.66
PDS5BQ9NTI5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
PDS5BQ9NTI5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC44.18■■■■■ 4.66
PDS5BQ9NTI5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
PDS5BQ9NTI5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
PDS5BQ9NTI5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
PDS5BQ9NTI5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
PDS5BQ9NTI5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
PDS5BQ9NTI5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
PDS5BQ9NTI5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
PDS5BQ9NTI5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
PDS5BQ9NTI5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
PDS5BQ9NTI5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.14■■■■■ 4.66
PDS5BQ9NTI5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
PDS5BQ9NTI5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
PDS5BQ9NTI5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.66
PDS5BQ9NTI5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC44.12■■■■■ 4.65
PDS5BQ9NTI5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
PDS5BQ9NTI5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
PDS5BQ9NTI5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
PDS5BQ9NTI5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
PDS5BQ9NTI5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
PDS5BQ9NTI5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
PDS5BQ9NTI5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
PDS5BQ9NTI5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
PDS5BQ9NTI5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
PDS5BQ9NTI5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
PDS5BQ9NTI5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.64
PDS5BQ9NTI5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
PDS5BQ9NTI5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
PDS5BQ9NTI5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
PDS5BQ9NTI5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
PDS5BQ9NTI5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
PDS5BQ9NTI5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
PDS5BQ9NTI5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
PDS5BQ9NTI5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC44.04■■■■■ 4.64
PDS5BQ9NTI5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.5 ms